MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 23522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	T	6	6	805	810	0 %	100 %	0 %	0 %	387825663
2	NC_017403	CTT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825663
3	NC_017403	TCA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
4	NC_017403	ATA	2	6	977	982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825663
5	NC_017403	AGC	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825663
6	NC_017403	ATT	2	6	1018	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825663
7	NC_017403	GTT	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825663
8	NC_017403	ATT	2	6	1129	1134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825663
9	NC_017403	TCC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825663
10	NC_017403	TAA	2	6	1207	1212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825663
11	NC_017403	C	6	6	1334	1339	0 %	0 %	0 %	100 %	387825663
12	NC_017403	T	7	7	1374	1380	0 %	100 %	0 %	0 %	387825663
13	NC_017403	C	6	6	1406	1411	0 %	0 %	0 %	100 %	387825663
14	NC_017403	TCA	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
15	NC_017403	AATC	2	8	1465	1472	50 %	25 %	0 %	25 %	387825663
16	NC_017403	TAAA	2	8	1506	1513	75 %	25 %	0 %	0 %	387825663
17	NC_017403	T	6	6	1535	1540	0 %	100 %	0 %	0 %	387825663
18	NC_017403	ATC	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
19	NC_017403	AATA	2	8	1606	1613	75 %	25 %	0 %	0 %	387825663
20	NC_017403	A	7	7	1749	1755	100 %	0 %	0 %	0 %	387825663
21	NC_017403	A	6	6	1759	1764	100 %	0 %	0 %	0 %	387825663
22	NC_017403	A	6	6	1766	1771	100 %	0 %	0 %	0 %	387825663
23	NC_017403	TA	3	6	1796	1801	50 %	50 %	0 %	0 %	387825664
24	NC_017403	AG	3	6	1843	1848	50 %	0 %	50 %	0 %	387825664
25	NC_017403	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825664
26	NC_017403	AT	3	6	1898	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	387825664
27	NC_017403	TAA	2	6	1931	1936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825664
28	NC_017403	AGGA	2	8	1947	1954	50 %	0 %	50 %	0 %	387825664
29	NC_017403	TCT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
30	NC_017403	AT	3	6	2035	2040	50 %	50 %	0 %	0 %	387825664
31	NC_017403	T	6	6	2081	2086	0 %	100 %	0 %	0 %	387825664
32	NC_017403	TAT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825664
33	NC_017403	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825664
34	NC_017403	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	387825664
35	NC_017403	CAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825664
36	NC_017403	GAA	2	6	2194	2199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
37	NC_017403	C	6	6	2202	2207	0 %	0 %	0 %	100 %	387825664
38	NC_017403	TCCC	2	8	2255	2262	0 %	25 %	0 %	75 %	387825664
39	NC_017403	GCTTT	2	10	2272	2281	0 %	60 %	20 %	20 %	387825664
40	NC_017403	AGA	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
41	NC_017403	AATT	2	8	2342	2349	50 %	50 %	0 %	0 %	387825664
42	NC_017403	AT	4	8	2377	2384	50 %	50 %	0 %	0 %	387825664
43	NC_017403	TAAA	2	8	2412	2419	75 %	25 %	0 %	0 %	387825664
44	NC_017403	GGCA	2	8	2454	2461	25 %	0 %	50 %	25 %	387825664
45	NC_017403	TAT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825664
46	NC_017403	TCT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
47	NC_017403	T	6	6	2577	2582	0 %	100 %	0 %	0 %	387825664
48	NC_017403	AAAT	2	8	2622	2629	75 %	25 %	0 %	0 %	387825664
49	NC_017403	AAAT	2	8	2645	2652	75 %	25 %	0 %	0 %	387825664
50	NC_017403	AT	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	387825664
51	NC_017403	TTG	2	6	2918	2923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825664
52	NC_017403	ACC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825664
53	NC_017403	AAAG	2	8	2947	2954	75 %	0 %	25 %	0 %	387825664
54	NC_017403	AAG	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
55	NC_017403	A	6	6	2999	3004	100 %	0 %	0 %	0 %	387825664
56	NC_017403	TAA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825664
57	NC_017403	CTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
58	NC_017403	T	7	7	3057	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	387825664
59	NC_017403	TTG	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825664
60	NC_017403	A	6	6	3221	3226	100 %	0 %	0 %	0 %	387825664
61	NC_017403	A	6	6	3430	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
62	NC_017403	TGA	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
63	NC_017403	GAT	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
64	NC_017403	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
65	NC_017403	ATAAAG	2	12	3527	3538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825665
66	NC_017403	TAA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
67	NC_017403	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
68	NC_017403	ATTGG	2	10	3601	3610	20 %	40 %	40 %	0 %	387825665
69	NC_017403	ATT	2	6	3637	3642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
70	NC_017403	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
71	NC_017403	CAAA	2	8	3671	3678	75 %	0 %	0 %	25 %	387825665
72	NC_017403	AGATT	2	10	3683	3692	40 %	40 %	20 %	0 %	387825665
73	NC_017403	T	6	6	3691	3696	0 %	100 %	0 %	0 %	387825665
74	NC_017403	TTTA	2	8	3757	3764	25 %	75 %	0 %	0 %	387825665
75	NC_017403	TGG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825665
76	NC_017403	ATA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
77	NC_017403	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
78	NC_017403	TTAA	2	8	3907	3914	50 %	50 %	0 %	0 %	387825665
79	NC_017403	TGA	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
80	NC_017403	TAA	2	6	3960	3965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
81	NC_017403	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
82	NC_017403	AGAA	2	8	3978	3985	75 %	0 %	25 %	0 %	387825665
83	NC_017403	A	6	6	3984	3989	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
84	NC_017403	AAAGA	2	10	4077	4086	80 %	0 %	20 %	0 %	387825665
85	NC_017403	A	6	6	4092	4097	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
86	NC_017403	AAT	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
87	NC_017403	GATA	2	8	4146	4153	50 %	25 %	25 %	0 %	387825665
88	NC_017403	TA	3	6	4190	4195	50 %	50 %	0 %	0 %	387825665
89	NC_017403	TAT	2	6	4224	4229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
90	NC_017403	AATG	2	8	4249	4256	50 %	25 %	25 %	0 %	387825665
91	NC_017403	AT	3	6	4278	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	387825665
92	NC_017403	ATC	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
93	NC_017403	A	6	6	4391	4396	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
94	NC_017403	TAT	2	6	4435	4440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
95	NC_017403	A	6	6	4449	4454	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
96	NC_017403	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
97	NC_017403	A	6	6	4499	4504	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
98	NC_017403	T	6	6	4512	4517	0 %	100 %	0 %	0 %	387825665
99	NC_017403	TAGAG	2	10	4533	4542	40 %	20 %	40 %	0 %	387825665
100	NC_017403	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
101	NC_017403	GATT	2	8	4592	4599	25 %	50 %	25 %	0 %	387825665
102	NC_017403	TAC	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
103	NC_017403	ATT	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
104	NC_017403	ACA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825665
105	NC_017403	GTAAT	2	10	4799	4808	40 %	40 %	20 %	0 %	387825665
106	NC_017403	ATC	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
107	NC_017403	A	6	6	4819	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
108	NC_017403	TAA	2	6	4908	4913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
109	NC_017403	AGT	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
110	NC_017403	TTC	2	6	4995	5000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825665
111	NC_017403	GGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825665
112	NC_017403	TAA	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
113	NC_017403	TTG	2	6	5039	5044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825665
114	NC_017403	CTA	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
115	NC_017403	A	6	6	5149	5154	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
116	NC_017403	TAA	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
117	NC_017403	A	6	6	5160	5165	100 %	0 %	0 %	0 %	387825665
118	NC_017403	TAA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
119	NC_017403	TTC	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
120	NC_017403	T	6	6	5260	5265	0 %	100 %	0 %	0 %	387825666
121	NC_017403	T	6	6	5268	5273	0 %	100 %	0 %	0 %	387825666
122	NC_017403	ATTCC	2	10	5290	5299	20 %	40 %	0 %	40 %	387825666
123	NC_017403	TAC	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
124	NC_017403	CTTG	2	8	5364	5371	0 %	50 %	25 %	25 %	387825666
125	NC_017403	TCA	2	6	5389	5394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
126	NC_017403	T	9	9	5403	5411	0 %	100 %	0 %	0 %	387825666
127	NC_017403	CTT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
128	NC_017403	A	6	6	5449	5454	100 %	0 %	0 %	0 %	387825666
129	NC_017403	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	387825666
130	NC_017403	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
131	NC_017403	CTT	2	6	5537	5542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
132	NC_017403	A	7	7	5556	5562	100 %	0 %	0 %	0 %	387825666
133	NC_017403	ATAA	2	8	5568	5575	75 %	25 %	0 %	0 %	387825666
134	NC_017403	T	9	9	5648	5656	0 %	100 %	0 %	0 %	387825666
135	NC_017403	TAA	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825666
136	NC_017403	TCG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825666
137	NC_017403	A	7	7	5680	5686	100 %	0 %	0 %	0 %	387825666
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